Il compito in Clone Ball Maze 3D è consegnare le palline al contenitore a forma di cono, che si trova all'uscita del labirinto. Passando attraverso il labirinto, prova ad aumentare il numero di palline con l'aiuto di sezioni speciali. Questo è necessario per superare le porte chiuse, nel qual caso dovrai sacrificare le palle e dovrebbero essere più che sufficienti per te.